Intel сотрудничает с Broad Institute, чтобы помочь победить рак
Intel объявила о сотрудничестве с Институтом Броуда Массачусетского технологического института и Гарварда, чтобы помочь исследователям-медикам обмениваться и обрабатывать важные медицинские данные в борьбе с раком.
Целью нового сотрудничества является ускорение геномных исследований. Геномные данные включают в себя последовательность ДНК человека и являются ключом к созданию точных методов лечения рака, но время, необходимое в настоящее время для упорядочения и передачи этих данных, сдерживает исследования.
Программы для Windows, мобильные приложения, игры - ВСЁ БЕСПЛАТНО, в нашем закрытом телеграмм канале - Подписывайтесь:)
Чтобы помочь, Институт Броуда сотрудничает с Intel, чтобы предоставить облачный доступ к своему программному пакету Genome Analysis Toolkit (GATK), а также совместно разрабатывать новые инструменты, которые облегчат исследователям хранение и обработку огромных объемов геномных данных. и помочь медицинским работникам разработать целевые планы лечения пациентов.
Intel уже использует облачные аналитические инструменты для коллективных наборов данных из Университета медицинских наук Орегона, Института рака Дана-Фарбер и Института исследований рака Онтарио в рамках своего проекта Collaborative Cancer Cloud, впервые анонсированного на IDF 2015.
Вверху: Институт Броуда.
«То, что мы делаем с Broad, просто сделает использование этих инструментов в среде совместной работы быстрее, лучше и дешевле», — сказал Брайс Олсон, директор по глобальному маркетингу подразделения здравоохранения и биологических наук Intel. «Затем, по мере того, как Совместное онкологическое облако будет расширяться и расти, оно поможет исследователям быстрее делать открытия и делать жизнь таких пациентов, как я, намного лучше».
Олсон сам пережил рак, отчасти благодаря целевому плану лечения от наркозависимости, разработанному на основе данных геномного секвенирования. Он пояснил, что партнерство с Институтом Броуда является последним достижением Intel, направленным на достижение нового уровня сотрудничества в области медицинских исследований.
Программы для Windows, мобильные приложения, игры - ВСЁ БЕСПЛАТНО, в нашем закрытом телеграмм канале - Подписывайтесь:)
«Сегодня, когда имеются геномные данные, фактически не существует баз данных», — сказал Олсон. «Нет стандартной базы данных вообще. Когда вы работаете над чем-то вроде запуска GATK для обнаружения вариантов, вы в основном читаете и записываете эти гигантские текстовые файлы. Впервые появится настоящая база данных, которая сможет ускорить работу».
В число разрабатываемых инструментов входит GenomicsDB, оптимизированная версия TileDB, разработанная MIT и исследователями Intel, работающими в Научно-технологическом центре Intel для больших данных. Существует также Cromwell, механизм выполнения рабочих процессов, который расширяется для поддержки нескольких языков ввода и одновременного выполнения на нескольких бэкэндах. И TileDB, и GenomicsDB выпускаются как инструменты с открытым исходным кодом.
Партнерство с Broad знаменует собой последнюю веху в расширении Collaborative Cancer Cloud от Intel. В конце марта Институт рака Дана-Фарбер и Институт исследования рака Онтарио присоединились к проекту больших данных, и Олсон считает, что совместный геномный анализ будет продолжать развиваться как ключевое оружие в борьбе с раком и другими опасными для жизни заболеваниями. .
«Я вижу, что в будущем все онкологические больные будут проходить геномное секвенирование», — сказал Олсон. «Мутации, обнаруженные в их опухолях, будут известны и поняты. Будет прямая связь между этими мутациями и планами целевого лечения, которые превратят рак в управляемое заболевание».
